Katedra Biotechnologii została utworzona w roku 2008 w wyniku zmiany profilu badawczego ówczesnego Zakładu Chemii Środowiska oraz poszerzenia składu osobowego o specjalistów z zakresu biotechnologii. Funkcję pierwszego kierownika ówczesnego powstałego Zakładu Biotechnologii w latach 2008-2011 sprawował prof. Bogdan Sieliwanowicz. Od 2012 roku kierownikiem jednostki jest dr hab. inż. Grzegorz Kłosowski prof. uczelni. W 2014 roku ówczesny Zakład Biotechnologii przeszedł gruntowną restrukturyzację obejmującą przeniesienie do nowopowstałych laboratoriów w budynku przy ulicy Poniatowskiego 12, znaczące doposażenie w nowoczesną aparaturę naukowo-badawczą oraz powołanie nowych struktur w ramach jednostki:

• Laboratorium Technologii Fermentacyjnych i Bioprocesów;
• Pracownia Biotechnologii Żywności. 

Obszary badawcze:

Katedra Biotechnologii prowadzi badania z zakresu białej biotechnologii (biotechnologii przemysłowej) a w szczególności nad:

• Doskonaleniem metod obróbki wstępnej (ang. pretreatment) biomasy lignocelulozowej oraz enzymatycznej degradacji polisacharydów (skrobia, biomasa celulozowa);
• Oceną reakcji metabolicznej drożdży cerevisiae na stres toksyczny wywołany obecnością inhibitorów (produkty uboczne obróbki wstępnej biomasy lignocelulozowej, mykotoksyny) w podłożach fermentacyjnych.
• Skriningiem oraz charakterystyką cech biotechnologicznych mikroorganizmów wykorzystywanych w procesach fermentacyjnych (synteza mikrobiologiczna biosurfaktantów, naturalnych dodatków do żywności – np. pirazyn);
• Poprawą efektywności ekonomicznej produkcji etanolu poprzez optymalizację operacji i procesów jednostkowych;
• Wpływem procesu technologicznego na skład lotnych produktów ubocznych fermentacji;
• Pozyskiwaniem oraz charakterystyką ektoenzymów grzybów strzępkowych (celulaz) wykorzystywanych do degradacji polimerów wielkocząsteczkowych (biomasy celulozowej).

Aparatura Katedry Biotechnologii:

• Chromatograf gazowy model 7890 firmy Agilent Technologies wyposażony w dwa detektory płomieniowo-jonizacyjne (FID) oraz automatyczny dozownik prób,
• Chromatograf cieczowy model 1260 firmy Agilent Technologies wyposażony w pompę gradientową, dodatkowy termostat oraz detektory refraktometryczny oraz diodowy,
• Bioreaktor firmy Eppendorf (BioFlo 115) o pojemności naczynia roboczego 7,5 l wyposażony w system kontroli pH, poziomu i temperatury oraz możliwość jałowego pobierania próbek,
• Spektrometr w podczerwieni FTIR model Nicolet IS 5 firmy Thermo Scientific z przystawką ATR z kryształem diamentowym umożliwiającym analizy ciał stałych, cieczy, past oraz pomiary ciał stałych techniką transmisyjną,
• Czytnik mikropłytkowy Synergy HTX firmy BioTek umożliwiający pomiar absorbancji UV-Vis, luminescencji, fluorescencji z góry i z dołu z wytrząsaniem i inkubacją do 50°C,
• Automatyczny analizator włókna Fibertec 8000 firmy FOSS,
• Systemem do dokumentacji żeli agarozowych, poliakrylamidowych oraz wyników analiz Western Blot za pomocą metod fluorescencyjnych, chemiluminescencyjnych i kolorymetrycznych ChemiDoc firmy BIORAD.
• Spektrofotometr UV-Vis Pharo 300,
• Wirówka laboratoryjną z chłodzeniem MPW 260R,
• System do elektroforezy firmy BIO-RAD,
• System do półsuchego transferu do western blottingu firmy BIO-RAD,
• Mineralizator mikrofalowy MARS 5,
• Refraktometr laboratoryjny stacjonarny typu Abbego z odczytem elektronicznym firmy Index Instruments,
• Wagosuszarki firmy RADWAG,
• Wagi analityczne i techniczne,
• Polarymetr,
• Autoklawy,
• Mikroskopy optyczne OLYMPUS i NIKON z kamerą i systemem analizy obrazu,
• Młyn bijakowy laboratoryjny,
• Szklany zestaw destylacyjny (odpędowy) 25 półkowy z płaszczem grzejnym i sterowaniem automatycznym (termometr kontaktowy, przekaźnik, regulator mocy),
• Wiskozymetr Ubbelohde’a z płaszczem wodnym,
• System do oczyszczania prób z wykorzystaniem techniki SPE.
• Tensjometr laboratoryjny,
• Laboratoryjna wyparka próżniowa.